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次世代シーケンサー(NGS)データ解析

GATK Best Practices®に準拠した解析をご提供いたします。

解析パイプライン

図1

Xenograftデータも対応致します。

  1. 1QIAGEN社のHGMD Downloadライセンスが必要
  2. 2COSMICはWellcome Sanger Instituteのライセンスが必要

ポスト解析

  1. 1.バイアス解析
  2. 2.Case-control study
  3. 3.Deleterious変異遺伝子解析
  4. 4.Loss of function解析
  5. 5.エキスパートパネル支援

RNA-seqデータの発現量解析のバイアス解析の例

図2

エキスパートパネル支援のためのアノテーションレポートの例

図3
図4
  • *GATK BEST PRACTICESは、The Broad Institute, Inc.の登録商標です。
  • *HGMDは米国QIAGENの米国およびその他の国における登録商標または商標です。